顺应潮流:仅血清ctDNA-MRD检测的应用前景!

2022-02-21 04:00:11 来源:
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"底物被归入MRD检验的发展此脆弱功能性是明确的,决心这些方面将在此之后降低下一代MRD检验的功能性能。"

白血病的MRD检验是一种敏锐且特异的用以追踪白血病病人肾脏中都源功能性遗传物质(如ctDNA)相对于数量的法则。在这种状态下,病人很难见光可见的鳞状,但毕竟长期存在标准针灸摄影机法则无法检验到但最后就会导致白血病罹患的或多或少鳞状。

MRD,常叫作或多或少移借助于鳞状(Minimal Residual Disease)。用于“Minimal” (或多或少)这个词,是因为它在文献和针灸科学家中都格外都用。不过,“Minimal”这个词可能有着“虚有假”,因为除此以外的病症在临床表现和用药对政府方面也可能有着极其重要涵义。“Measurable”(可测定)一词可格外恰当地叙述移借助于在病人人体内的肝细胞的长期存在。NCCN范本同时用于了“Minimal Residual Disease”(或多或少移借助于鳞状)和“Measurable Residual Disease”(可测定移借助于鳞状)两个该词。

此外,可行功能性科学研究表明在分子低水平上检验多种白血病类别的ctDNA比如说有着针灸依赖功能性,文献和针灸科学家有时也就会用于“Molecular Residual Disease”(分子移借助于鳞状)一词。

国际上,国际上在实质上中都基于ctDNA的MRD深入研究报告(ctDNA-MRD)的针灸取样和迹象愈加多,开启了实质上肿MRD检验的浪潮。实质上肿ctDNA-MRD检验的关键技术流派主要有两大类:

1)Tumor-informed assays(不知情深入研究)

对原发秘密组织进行时DNA以认定病人的特异序列个体差异图谱,然后设计多肽选用panel或用于通常panel进行时人功能性化的ctDNA检验深入研究。

2)Tumor-uninformed assays(告知深入研究)

也可以叫作Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays,即无需原发秘密组织,仅有具体来说四组预先选定多肽/剪切设计的与白血病类别之外的通常panel进行时ctDNA检验深入研究,恰巧检验ctDNA功能性状的同时,借助于ctDNA底物或相片组学等都能学法则。弥补了秘密组织取样极低或追踪底物极低或TAT以致于等问题。

Tumor-informed assays的关键技术解决方案格外符合大众的认知,在保证高N-化的此前提下,可通过追踪多底物的sample-level(取样低水平)大大降低其频率,关键技术限额相对于来说不是尤其高。Tumor-uninformed assays的关键技术解决方案格外值得注意要到筛,通过降低site-level(底物低水平)检验频率并借助于ctDNA底物或相片组学并转化神经网络算法大大降低其频率和N-化,关键技术限额相对于来说较高。

2021年4月末29日,《Clinical Cancer Research》在线借助于版了“仅有用于肾脏ctDNA检验缘直肠癌病人或多或少移借助于鳞状(MRD)”的文章,首次公开了Guardant Reveal的科学研究取样:MRD检验频率多超过91%,N-化多达100%,这些发现支持了仅有肾脏ctDNA-MRD检验(Tumor-uninformed assays)的潜在针灸运用以。

2021年8月末13日,《Clinical Cancer Research》在线借助于版了“顺应潮流:仅有肾脏ctDNA-MRD检验的运用以此脆弱功能性”的文章,在这中都科学学者们咨询深入研究报告了仅有肾脏ctDNA检验MRD的能力,以及将底物拆分到ctDNA检验的潜在好处。2

Parikh及其室友1 和Taieb及其室友3 咨询了仅有肾脏ctDNA-MRD检验在缘直肠癌(CRC)病人中都的潜在针灸运用以。

▲ ctDNA底物和功能性状在两项科学研究中都的运用以比较(Parikh和Taieb)

缘直肠癌(CRC)的用药始终遭遇着一个挑战,即相当多的CRC病人因要到期疾病罹患而过要到遇害。尽管针灸采用了标准的特别设计用药,但长期功能性IIIC期CRC病人的5年生存领军也仅有有53%,究其原因是很难发现摄影机学上未检验到的或多或少移借助于鳞状(MRD)。4

现阶段,仍迫切必需恰当确定哪些病人术后长期存在MRD,以帮助监督减少或减低特别设计用药,并减低康复的风险,同时尽量地减少故意用药的之外刺激功能性。

在以此前的几年中都,我们对ctDNA在CRC病因和临床表现中都的运用以有了广泛的了解。现阶段,基于ctDNA的MRD深入研究报告正广泛运用以于白血病的用药中都。

ctDNA是由DNA的预告相片组成(大约130-150bp),由肝细胞通过凋亡、发炎或黏液释放到循环系统中都。 ctDNA的半衰期格外长致使其成为寻常的系统就会负荷遥相呼应,它的长期存在可能反映了摄影机学上看不见的微移出。

在康复功能性用药过后后,ctDNA中都借助于现的体细胞功能性状对随后的摄影机学罹患有着较高的无症状预报经济效益,尤其是当这些功能性状与动手术的秘密组织中都的功能性状相关联时。检验这种ctDNA界定的MRD可以在I-III期CRC中都提此前摄影机学数月末预报罹患,从而为四组最后就会罹患的CRC病人透过一个深入研究报告新疗法的窗口。然而,这些ctDNA框架功能性状界定的MRD检验法则的频率始终是有限的,迫切必需革新其检验功能性能。

ctDNA的底物检验比起ctDNA的框架功能性状检验。ctDNA的底物异恰巧CRC中都格外加类似,并被看做大多数皮肤癌的要到期阶段。这种底物,具体界定为DNA中都核苷酸的C5右方添加N-基团,适度附近等位基因的表多达,都有经典作品的抑癌等位基因失活。与框架功能性状相较,CRC中都长期存在格外多的底物精神状态区域,为降低MRD检验的频率透过了从中。SEPT9,就是第一个透过肾脏检验单等位基因底物精神状态进行时筛查和要到期检验CRC的法则。尽管ctDNA底物有这些优点,但这些相同的特功能性也必需果断,以保证检验深入研究的N-化,并可避免有假无症状的风险。

在这种取材下,Parikh和Taieb的除此以外最新科学研究缘果为我们对ctDNA功能性能的理解透过了有用的极低之处,即无需原发秘密组织,仅有通过肾脏ctDNA底物或合组ctDNA功能性状方能进行时恰当的MRD深入研究报告。与其他必需对原发秘密组织进行时DNA以监督后续ctDNA深入研究的检验各不相同,除此以外科学研究探讨了Tumor-uninformed assays的有效功能性,它有几个战术上,都有快速的TAT,减低初始开发成本,对秘密组织极低或不必需的病人进行时追踪。

Parikh等人透过了一种ctDNA底物转化ctDNA框架功能性状的通常panel进行时MRD的深入研究深入研究报告(NGS法则),与其他零售上必需的MRD检验法则相较,这种法则不必需动手术的秘密组织以及选用化。在最后用药后用于时,这种仅有肾脏ctDNA-MRD检验对罹患有着针灸涵义的N-化(100%)和频率(55.6%),通过拆分或多或少序列构造和斜向追踪深入研究,其频率可大大降低至91%。1 该法则被用以打算进行时的批判功能性科学研究,都有监督IIA期缘肠癌用药对政府的NRG合作组科学研究(NCT04068103)。虽然还必需额外的取样集来测试这些发现,但这些缘果得出缘论基于ctDNA的MRD检验在告知的情况下可不能接受的检验功能性能构造。

Taieb等人的科学研究透过了一对此此前被证明是CRC动手术后临床表现之外的底物等位基因标记物WIF1和NPY(ddPCR法则),并将它们运用以于PRODIGE-GERCOR IDEA-France试验功能性,将III期CRC病人随机统称3个月末 vs 6个月末的特别设计抗生素。在对参加III期试验功能性的III期CRC病人进行时的首次ctDNA-MRD深入研究报告中都,有13.8%的病人术后为ctDNA-MRD无症状,并被确认为脱离的临床表现遥相呼应。3 同时,科学学者也指借助于,与其他采用NGS法则的ctDNA-MRD科学研究相较,本科学研究中都ctDNA的无症状领军较低。频率和PPV比如说大于NGS检验缘果,ctDNA-MRD无症状和阴功能性的5年DFS则有65%和73%,尽管特别设计用药的和不理想的此前深入研究取样检视就会对这些缘果产生阻碍。该法则值得一提的是的是其相对于最简单,格外加低的开发成本和潜在的重现功能性,不必需零售检验中都所见的专利检验法则。打算进行时的批判功能性科学研究将进一步深入研究报告仅有肾脏ctDNA检验是否必须恰当深入研究报告MRD,以便对CRC病人进行时风险分层,并监督特别设计用药对政府。

无论采用何种法则,仅有用肾脏ctDNA-MRD检验来监督CRC病人的用药提议,必需可靠且恰当的检验法则。需大大降低仅有肾脏ctDNA-MRD检验的频率来确定哪些病人可以从用药降级中都获益,以避免不恰当地选择高危病人不能接受较低强度的用药。Parikh及其室友的科学研究得出,拆分序列和或多或少序列以及斜向肾脏追踪,可明显降低仅有肾脏ctDNA-MRD的频率。相较之下,ctDNA-MRD检验的高N-化对于ctDNA作为一个完整的生物遥相呼应来确定用药升级是至关极其重要的。由于N-化极低,有假无症状的ctDNA-MRD就会使病人不能接受故意的强化用药。Parikh及其室友的科学研究缘果证明,除框架功能性状外,还可以通过转化或多或少序列底物构造的深入研究来保证N-化。Taieb等人的深入研究法则的战术上在于降低了针灸构造的频率和临床表现,但是,正如科学学者承认的那样,单独的两个等位基因底物标记可能无法透过与转化框架功能性状法则的功能性能构造。极其重要的是,这项岗位也阐释了规范化深入研究此前条件的极其重要功能性,因为各种提取法则可以在很大程度上阻碍ctDNA的得领军和完整功能性。在未来会的科学研究中都,这些深入研究此前的考虑将变得愈加极其重要。

底物被归入MRD检验的发展此脆弱功能性是明确的,决心这些方面将在此之后降低下一代MRD检验的功能性能。总之,仅有肾脏ctDNA-MRD的检验透过了一个独特的从中,用于一种无创法则来探险用药计划,并有可能根除高危病人的微移出功能性鳞状。这些科学研究缘果却是为未来会ctDNA-MRD监督的批判功能性针灸试验功能性坚持不懈了道路。

MRD,始终是一个快速发展的运用以,我们原订近两年就会借助于现新的迹象,要么显示借助于MRD检验的针灸依赖功能性的显然,要么显示借助于MRD检验的其他战术上和新用途。

简要:

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.

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